しかし、それを脅威に感じた『ホーリーホワイト』は、魔法少女アクリルブルーとアクリルレッドに襲撃を命令し、研究施設を壊滅させた。
源蔵は、多くの部下や研究資料を失い、自身もまた、瀕死の重症を負う。
なんとか改造手術を受け、怪人として生まれ変わることで九死に一生を得たが、失ったものも多かった……
目覚めた源蔵は怒り狂い、自分から多くを奪った魔法少女に復讐を誓う。それもただの復讐ではない。
恥辱に顔を歪ませながら、魔法少女の象徴たるコスチュームを自らの手で脱がせ、膝を折り、頭を地面にこすりつけさせる。

面を汚し、名を折り、辱める究極の謝罪
―――全裸土下座！

源蔵は、その後、本部に招集され、科学技術班班長抜擢され、その地位と科学力を駆使し、憎き魔法少女、アクリルレッド、アクリルブルーを土下座させるために行動を開始する。